CNW液相色譜柱在平衡過程中，將流速緩慢地進步用活動相平衡CNW液相色譜柱直到獲得穩定的基線（緩沖鹽或離子對試劑濃度假如較低，則需要較長的時間平衡）。
CNW液相色譜柱的使用：
CNW液相色譜柱在使用前，進行柱的性能測試，并將結果保存起來，作為今后評價柱性能變化的參考。但要注意：柱性能可能由于所使用的樣品、流動相、柱溫等條件的差異而有所不同；另外，在做柱性能測試時是按照色譜柱出廠報告中的條件進行(出廠測試所使用的條件是*條件)，只有這樣，測得的結果才有可比性。
CNW液相色譜柱的保存：
（1）反相色譜柱天天實驗后的保養：
使用緩沖液或含鹽的活動相，實驗完成后應用10%的甲醇/水沖洗30分鐘，洗掉色譜柱中的鹽，再用甲醇沖洗30分鐘。留意：不能用純水沖洗柱子，應該在水中加進10%的甲醇，防止將填料沖塌陷。
（2）長期保存色譜柱：
如色譜柱要長時間保存，必須存于合適的溶劑下。對于反相柱可以儲存于純甲醇或乙腈中，正相柱可以儲存于嚴格脫水后的純正己烷中，離子交換柱可以儲存于水（含防腐劑*或柳硫汞）中，并將新色譜柱的堵頭堵上。儲存的溫度是室溫。
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